Su principal actividad es la calificación de derechos para el pago de subsidios por incapacidad temporal en los riesgos de Accidentes, Enfermedad y Maternidad –EMA- de los afiliados y sus beneficiarios.

Para brindar una mayor cobertura, en la Ciudad Capital y Villa Nueva del Departamento de Guatemala, cuenta con 10  oficinas, entre la Sede Central y Unidades Subsidiarias,  ubicadas en:

• Oficina Central (Edificio Torre Café, tercer piso), 7ª. Ave. 1-20 zona 4.
• Hospital de General de Enfermedades,  9ª. Calle 7-55 zona 9, Tel: 2331-1430.
• Hospital de Rehabilitación,   14 Avenida y 4ª. Calle, zona 12. Colinas de Pamplona.  Tel:  2471-4202.
• Hospital General  “Dr. Juan José Arévalo Bermejo”, 19 Avenida 7-14 zona 6.  Tel:  2288-1157.
• Hospital General de Accidentes, 7-19,   13 Avenida y Calzada San Juan, Zona 4, Mixco.  Tel:  2437-9663.
• Policlínica,   7ª. Avenida y 17 calle Zona 1. Tel:   2251-5227.
• Unidad Periférica Zona 5,  Diagonal 14, 16-93 zona 5. Tel: 2335-1314.
• Unidad Periférica Zona 11,  5ª. Avenida  10-86 Zona 11. Tel:   2475-5150.
• Consultorio IGSS Villa Nueva,  16 Avenida 0-64 Zona 4, Villa Nueva.  Tel: 6631-3409  y 6631-3415.
• Consulta Externa  “La Autonomía”,   Diagonal 12, 0-03 Zona 9.  2412-1244. 

El Departamento de Prestaciones en Dinero, ubicado en el Edificio Torre Café,  7ª. Ave. 1-20 zona 4, Ciudad de Guatemala, Teléfono: 2412-1224 y extensión:  (Ver la Sección correspondiente), está dividido en las siguientes secciones:   

• Cobros al Patrono: Realizan trámites de cobro a patronos por atención médica y subsidios otorgados sin derecho.  Ext.  83027.
• Prestación Ulterior:   Tramita el pago único que se da a un afiliado a causa de la pérdida de un miembro (amputación), o alguna facultad física (vista, etc.), derivada de algún accidente.  Ext.  83027.
• Pensiones por Causa de Muerte: Pagos de los casos por Causa de Muerte  según Acuerdo 97 Junta Directiva, que fueron autorizado en su oportunidad.   Ext.  83013.
• Subsidios por Maternidad: Tramita los subsidios de los casos atendidos en el Hospital de Gineco-Obstetricia, San Juan Sacatepequez, Villa Canales y Amatitlán.             Ext. 83015 y 83016.
• Subsidios por Tratamiento Médico Particular: Tramita los pagos de subsidios por incapacidad temporal a los afiliados que acuden a los servicios médicos particulares.               Ext. 83028.
• Reintegros y Abono Cuenta Estado: Se tramitan los reintegros y abonos a efectuar al Patrono Estado por las suspensiones de labores de sus trabajadores y que fueron documentados como afiliados al Instituto.