Este Departamento es el encargado de supervisar la transparencia y calidad de los servicios médicos y contratados del instituto.

Adicionalmente detecta las causas de surgimiento o persistencia de debilidades de los sistemas de control y supervisión, así como la identificación de medidas preventivas y correctivas, proponiendo aquellas medidas y acciones que mejoren y hagan efectivas la función de supervisión a todo nivel en el Instituto.